具体设计规则：

长度

合成PNA序列的长度通常不超过18个碱基，不包括接头、氨基酸和标记物。 PNA序列中可以添加一个赖氨酸或半胱氨酸作为氨基酸修饰，这可以位于序列的N端或C端。

嘌呤含量

嘌呤含量的控制对于PNA的聚合反应及水溶性至关重要。为避免聚合，应将嘌呤含量限制在60%以下。例如，序列GATTAGCAGTCTACG是可行的，因为其嘌呤含量低于60%。在序列中，连续出现的嘌呤不得超过4个，而鸟嘌呤不得超过3个。例如，序列ATTAGGGGCATCTAC因含有4个连续的G而不可行；而CTAGATAGAAGGTTC则因含有6个连续的嘌呤而不可行。如果无法避免上面的限制，可以考虑探针的互补链，例如GTAGATGCCCCTAAT是可行的，因为其为上面序列的互补序列，没有违反任何准则。

自我互补序列

为避免自我互补序列的形成，尤其是反向重复、发夹和回文序列，建议保持基本设计原则。由于PNA/PNA相互作用比PNA/DNA更强，此类探针容易导致聚合。在互补的四个碱基中，C和G的组合只在间隔一个或多个碱基时才可行。例如，序列GATAATTGCA是可行的，而GATCCGGTAC因只有CCGG互补而不可行；TATCCTGGTA则因CC、GG之间间隔一个碱基而可行。而六个及以上碱基的互补是不可行的，如CTATTAATGCA就是一个例子，而AGTGCTACT则是可行的。

一般规则

我们强烈建议设计反向平行的PNA探针。虽然PNA可以在任一方向形成双链，反向平行取向优先，形成最常见的双链结构。特别是在反义和DNA探针应用中，反向平行是最优先的构象。当PNA探针处于反向平行取向时，其N端对应于DNA的5’端。需要注意的是，PNA的熔点Tm不同于DNA。由于PNA链是不带电的，PNA-DNA的Tm值通常会高于相应的DNA-DNA对。在100mM NaCl浓度下，每增加一个碱基，Tm值大约提高1°C。在较低盐浓度中，Tm值的差异会更加显著。通常，一个含10个碱基的PNA，其Tm值约为50°C，含15个碱基的PNA其Tm值则约为70°C。12至17个碱基的PNA序列最为理想。序列长度依赖于特定的应用需求，PNA探针在DNA应用中所需的长度通常更短。长链PNA易于聚合，导致纯化和表征困难；而短序列则显示出更强的特异性，因此在设计时需考虑不匹配对结果的影响。

订单与交货信息

尊龙凯时的PNA订购价格根据序列长度、产量、纯度及修饰标记而异。如有具体需求，请及时与我们联系。最低订购量为：未标记PNA 20 nmole，标记PNA 10 nmole。我们提供90%和95%的纯度选择，且可提供HPLC纯度分析和质谱分析报告。一般情况下，订单交货周期为2-3周，特殊要求如gammaPNA或修饰标记则为3-4周。

相关引用

如想了解使用尊龙凯时PNA的相关研究文献，以下是一些精选引用：

• Exponential Increase in an Ionic Signal: A Dominant Role of the Space Charge Effect on the Outer Surface of Nanochannels Anal Chem | 28 Sep 2021 All single-stranded PNA sequences were purchased from SBS Genetech Co, Ltd (Beijing, China)
• Peptide Nucleic Acid-Functionalized Nanochannel Biosensor for the Highly Sensitive Detection of Tumor Exosomal MicroRNA Anal Chem | 30 July 2021 PNA was synthesized by SBS Genetech Co Ltd (Beijing, China)
• Ultrasensitive Exosomal MicroRNA Detection with a Supercharged DNA Framework Nanolabel Anal Chem | 2 April 2021 Thiolated PNA with a −(CH2)6− spacer at the 5′ end was synthesized and purified by SBS Genetech Co, Ltd (Beijing, China)